写在前面
万万没想到 chatGPT，我玩了整整一个周末。当然，我不是在玩 chatGPT。而是在想，这样一个工具，我们如何更好的使用他，从而解决日常生信数据分析中的简单问题。要知道，绝大多数湿实验科研朋友的数据分析需求，其实是简单的文本处理。TBtools 当然，可以满足不少需求，但总有一些，并不如此。于是，大伙还是要去求助某某。
chatGPT 可以相对较好的理解我们想说的话。我测试了下，对于简单的文本处理工作，他完全可以直接生成可用代码。
为此，我决定直接对 TBtools 和 CLI Program Wrapper Creator 进行改造，让他们支持直接脚本编写执行（当然，同时也支持了其他各类语言的脚本，只是需要插件开发者打包一个解释器，如python或perl等）。如此，我们就完全可以让「chatGPT」和「TBtools」联动，实现我们的「春秋大梦」。
示例 2：Fasta序列批量提取
跟 chatGPT 说
用 java 代码实现一个命令行脚本，接受三个参数，第一个是一个ID列表文件，每行一个 ID，第二个是一个 Fasta 序列文件，第三个是输出文件。需要提取 Fasta 序列文件中 ID 在列表文件中存在的序列，输出到输出文件
结果如下
代码直接复制到 TBtools 中，简单填充界面
完成插件开发，惊呆了！
示例 1：表格行批量提取软件
我们有一个基因表达量矩阵，可能有100Mb，我们需要从里面提取是100个基因的表达量。我用一句话描述了任务需求，发给「chatGPT」
# chatGPT 镜像链接，无需登录，直接使用
https://gpt.chatapi.art/
具体描述如下
使用java代码实现，接受三个命令行参数，第一个参数是接受一个表格文件，表格文件中有行名，有列名，第二个参数是一个ID列表文件，每一行是一个ID，第三个参数是输出文件。这个代码主要功能是，按照ID列表文件中的ID提取表格文件中第一列匹配到ID的所有行，匹配内容输出到输出文件。注意，最终文件同样需要有行名和列名。
得到结果如下
打开 TBtools（注意，你需要升级到1.106或者更高版本，使用安装器），转到 「CLI Program Wrapper Creator」功能（注意，插件也需要更新一下），点击「Click X for Script Input」
设置一下文件名，黏贴从 chatGPT 复制过来的代码
按照我们描述的需求和chatGPT给出的使用方法（其实也就是我们的需求）
配置界面如下
大功告成，我们测试一下
直接复制这些报错，丢给「chatGPT」
运行了下，发现没有正确提取
让他重新写一个。结果网页链接断开了，镜像不稳定。没事，重新来
更新代码，再次尝试
又报错了，让他改，反正 chatGPT 真的是一个机器......「无情的我.....」
完成.....
虽然过程有点波折，不过我们成功开发了一个批量表格提取工具！然后就可以导出插件。
OK，我们可以测试一下插件安装和使用，安装好了，完美使用
从此，我们可以直接用这个插件来批量提取行，可以发给你的实验室同门，大家都可以用了。
写在最后
很强！当然，对于一些相对复杂的逻辑，或许需要比较具体的描述。总之，欢迎大伙联用两者，实现自己的想法，开发出有用，实用的插件，分享给朋友和所有TBtools用户。