说实话，我学生信最先接触的也是转录组，只是似乎转录组早就走到了穷途末路，最近一直没什么新花样了。慢慢地单细胞空间组学有了一点意思，不过对没有实验条件的同学或者医生，或者基础不太好的同学，等学会又烂大街了！在这里我介绍一种最近看到的思路就是：QTL+孟德尔随机化。孟德尔随机化因为可以发现因果关系备受杂志青睐，与RCT直接相关，两者有很高的相似性，孟德尔随机化的核心其实是利用了孟德尔第二定律，也就是自由组合规律(law of independent assortment），当具有两对（或更多对）相对性状的亲本进行杂交，在子一代产生配子时，在等位基因分离的同时，非同源染色体上的基因表现为自由组合，这一过程类似于随机对照试验中的随机分组。eQTL是指与单个基因 mRNA 表达量相关的 DNA 突变。eQTL可分为顺式作用eQTL（cis-eQTL）和反式作用eQTL（trans-eQTL）。QTL研究本身具有重要的研究意义，能够阐明DNA序列变异与可定量化的中间分子表型的量化调控关系。基于eqtl或pqtl数据开发，并结合疾病GWAS数据来映射疾病相关联的基因、蛋白等，从而揭示疾病发病机制及筛选药物靶点（直接复制的）。意思就是：有公共数据+挖掘+大力出奇迹，最重要的是不需要实验+能出高分！文章1：Circulating Proteins Influencing Psychiatric Disease: A Mendelian Randomization Study. DOI: 10.1016/j.biopsych.2022.08.015.文章2：Association between genetically proxied PCSK9 inhibition and prostate cancer risk: A Mendelian randomisation study. DOI:10.1371/journal.pmed.1003988.
都是10分以上的SCI，用的都是公共数据库，大家感兴趣的可以自己学习一下，网上资料不多，可能学习曲线比较长。有时间我再给大家复现一些高分的。